تمّ احداث اللجنة الوطنية لمكافحة الارهاب لدى رئاسة الحكومة وفقا للفصل 66 من القانون الأساسي عدد 26 لسنة 2015 المؤرخ في 07 أوت 2015 المتعلّق بمكافحة الإرهاب ومنع غسل الأموال،الذي تم تنقيحه واتمامه بموجب القانون الأساسي عدد 09 لسنة 2019 المؤرخ في 23 جانفي 2019، وضبط الأمر الحكومي عدد 1777 لسنة 2015 المؤرخ في 25 نوفمبر 2015 اجراءات تنظيمها وطرق سيرها لتنطلق فعليا في نشاطها يوم 22 مارس 2016 بعقد اجتماعها الاول بإشراف السيّد رئيس الحكومة.
تضمّ اللجنة 22 عضوا يمثلون مختلف الوزارات والهياكل الوطنية المرتبطة بصفة مباشرة أو غير مباشرة بمكافحة الإرهاب ويرأس اللجنة ممثل عن رئاسة الحكومة في حين يمثل نائبه وزارة العدل ويعمل كلاهما بالتفرغ كامل الوقت. وتؤمّن رئاسة الحكومة الكتابة القارة للجنة.